CAVALIERI, DUCCIO
CAVALIERI, DUCCIO
A computational pipeline to discover highly phylogenetically informative genes in sequenced genomes: application to Saccharomyces cerevisiae natural strains
2012-01-01 Ramazzotti, M.; Berna, L.; Stefanini, I.; Cavalieri, D.
A Genetic code alteration accelerates the acquisition of antifungal drug resistance in Candida albicans
2015-01-01 Weil, T.F.A.L.; Santamaría, R.; Lee, W.; Rung, J.; Tocci, N.; Simoes, J.S.; Bezerra, A.R.; Caretto, L.; Abbey, D.; Moura, G.R.; Bayés, M.; Gut, I.G.; Csikasz Nagy, A.; Cavalieri, D.; Berman, J.; Santos, M.A.S.
A systems biology approach to characterize the regulatory networks leading to trabectedin resistance in an in vitro model of myxoid liposarcoma
2012-01-01 Uboldi, S.; Calura, E.; Beltrame, L.; Nerini, I.F.; Marchini, S.; Cavalieri, D.; Erba, E.; Chiorino, G.; Ostano, P.; D'Angelo, D.; D'Incalci, M.; Romualdi, C.
Adaptive mistranslation accelerates the evolution of fluconazole resistance and induces major genomic and gene expression alterations in Candida albicans
2017-01-01 Weil, T.F.A.L.; Santamaría, R.; Lee, W.; Rung, J.; Tocci, N.; Abbey, D.; Bezerra, A.R.; Carreto, L.; Moura, G.R.; Bayés, M.; Gut, I.G.; Csikasz Nagy, A.; Cavalieri, D.; Berman, J.; Santos, M.A.S.
Age and gender affect the composition of fungal population of the human gastrointestinal tract
2016-01-01 Strati, F.; Di Paola, M.; Stefanini, I.; Albanese, D.; Rizzetto, L.; Lionetti, P.; Calabrò, A.; Jousson, O.; Donati, C.; Cavalieri, D.; De Filippo, C.
Altered gut microbiota in Rett syndrome
2016-01-01 Strati, F.; Cavalieri, D.; Albanese, D.; De Felice, C.; Donati, C.; Hayek, J.; Jousson, O.; Leoncini, S.; Pindo, M.; Renzi, D.; Rizzetto, L.; Stefanini, I.; Calabrò, A.; De Filippo, C.
An evaluation of the PacBio RS platform for sequencing and de novo assembly of a chloroplast genome
2013-01-01 Ferrarini, M.; Moretto, M.; Ward, J.A.; Surbanovski, N.; Stevanović, V.; Giongo, L.; Viola, R.; Cavalieri, D.; Velasco, R.; Cestaro, A.; Sargent, D.J.
Biodiversity of the human gut mycobiota and its adaptation to the gastrointestinal tract
2015-01-01 Strati, F.; Stefanini, I.; Di Paola, M.; Rizzetto, L.; Cavalieri, D.; De Filippo, C.
Bioinformatic approaches for functional annotation and pathway inference in metagenomics data
2012-01-01 De Filippo, C.; Ramazzotti, M.; Fontana, P.; Cavalieri, D.
BIOKIS: a model payload for multidisciplinary experiments in microgravity
2012-01-01 Vukich, M.; Ganga, P.L.; Cavalieri, D.; Rizzetto, L.; Rivero, D.; Pollastri, S.; Mugnai, S.; Mancuso, S.; Pastorelli, S.; Lambreva, M.; Antonacci, A.; Margonelli, A.; Bertalan, I.; Johanningmeier, U.; Giardi, M.T.; Rea, G.; Pugliese, M.; Quarto, M.; Roca, V.; Zanini, A.; Borla, O.; Rebecchi, L.; Altiero, T.; Guidetti, R.; Cesari, M.; Marchioro, T.; Bertolani, R.; Pace, E.; De Sio, A.; Casarosa, M.; Tozzetti, L.; Branciamore, S.; Gallori, E.; Scarigella, M.; Bruzzi, M.; Bucciolini, M.; Talamonti, C.; Donati, A.; Zolesi, V.
C. albicans with different genomic background reveal diverse host adaptation and differential processing by phagocytes
2015-09-01 Rizzetto, L.; Di Paola, M.; Colombari, B.; De Filippo, C.; Ardizzoni, A.; Berná, L.; Tocci, N.; Lionetti, P.; Blasi, E.; Cavalieri, D.; Peppoloni, S.
Carbon nanotube scaffolds instruct human dendritic cells: modulating immune responses by contacts at the nanoscale
2013-01-01 Aldinucci, A.; Turco, A.; Biagioli, T.; Toma, F.M.; Bani, D.; Guasti, D.; Manuelli, C.; Rizzetto, L.; Cavalieri, D.; Massacesi, L.; Mello, T.; Scaini, D.; Bianco, A.; Ballerini, L.; Prato, M.; Ballerini, C.
Characterization of fecal mycobiota reveals yeast-host coevolution in pediatric Crohn’s disease
2013-01-01 De Filippo, C.; Di Paola, M.; Rizzetto, L.; Stefanini, I.; Berná, L.; Ramazzotti, M.; Dapporto, L.; Rivero, D.; Gut, I.G.; Legras, J.L.; Massi Benedetti, C.; De Luca, A.; Romani, L.; Lionetti, P.; Cavalieri, D.
Characterization of fungal and bacterial communities in Rett syndrome patients
2014-01-01 Strati, F.; Albanese, D.; Donati, C.; Cavalieri, D.; De Filippo, C.; Renzi, D.; Jousson, O.; De Felice, C.; Hayek, J.; Calabrò, A.
Characterization of the bacterial and fungal microbiota in Rett syndrome
2015-01-01 Strati, F.; Albanese, D.; Renzi, D.; Rizzetto, L.; Stefanini, I.; Jousson, O.; Hayek, J.; De Felice, C.; Donati, C.; Calabrò, A.; Cavalieri, D.; De Filippo, C.
Commensal yeast S. cerevisiae trains human monocytes for a heightened cytokine response upon bacterial encounter
2015-09-01 Rizzetto, L.; Ifrim, D.I.; Tocci, N.; Cheng, S.C.; De Filippo, C.; Weil, T.F.A.L.; Lenucci, M.S.; Netea, M.G.; Cavalieri, D.
Comparative analysis of gene expression: uncovering expression conservation and divergence between Salmonella enterica serovar Typhimurium strains LT2 and 14028S
2015-01-01 Sonego, P.; Meysman, P.; Moretto, M.; Viola, R.; Laukens, K.; Cavalieri, D.; Engelen, K.A.
Comparative genomics of natural fertile hybrids of Saccharomyces cerevisiae, Saccharomyces bayanus and Saccharomyces paradoxus
2015-01-01 Donati, C.; Stefanini, I.; Ramazzotti, M.; Berná, L.; Gut, I.G.; De Filippo, C.; Cavalieri, D.
Deciphering the mechanism of action of 089, a compound impairing the fungal cell cycle
2018-01-01 Stefanini, I.; Rizzetto, L.; Rivero, D.; Carbonell, S.; Gut, M.; Heath, S.; Gut, I.G.; Trabocchi, A.; Guarna, A.; Ben Ghazzi, N.; Bowyer, P.; Kapushesky, M.; Cavalieri, D.
Diet and the gut microbiota: how the gut: brain axis impacts on autism
2014-01-01 Tuohy, K.M.; Venuti, P.; Cuva, S.; Furlanello, C.; Gasperotti, M.; Mancini, A.; Ceppa, F.A.; Cavalieri, D.; De Filippo, C.; Vrhovsek, U.; Mena, P.; Del Rio, D.; Fava, F.
| Data di pubblicazione | Titolo | Autore(i) | Tipo | File |
|---|---|---|---|---|
| 1-gen-2012 | A computational pipeline to discover highly phylogenetically informative genes in sequenced genomes: application to Saccharomyces cerevisiae natural strains | Ramazzotti, M.; Berna, L.; Stefanini, I.; Cavalieri, D. | Articolo in rivista | |
| 1-gen-2015 | A Genetic code alteration accelerates the acquisition of antifungal drug resistance in Candida albicans | Weil, T.F.A.L.; Santamaría, R.; Lee, W.; Rung, J.; Tocci, N.; Simoes, J.S.; Bezerra, A.R.; Caretto, L.; Abbey, D.; Moura, G.R.; Bayés, M.; Gut, I.G.; Csikasz Nagy, A.; Cavalieri, D.; Berman, J.; Santos, M.A.S. | Abstract in Atti di convegno | |
| 1-gen-2012 | A systems biology approach to characterize the regulatory networks leading to trabectedin resistance in an in vitro model of myxoid liposarcoma | Uboldi, S.; Calura, E.; Beltrame, L.; Nerini, I.F.; Marchini, S.; Cavalieri, D.; Erba, E.; Chiorino, G.; Ostano, P.; D'Angelo, D.; D'Incalci, M.; Romualdi, C. | Articolo in rivista | |
| 1-gen-2017 | Adaptive mistranslation accelerates the evolution of fluconazole resistance and induces major genomic and gene expression alterations in Candida albicans | Weil, T.F.A.L.; Santamaría, R.; Lee, W.; Rung, J.; Tocci, N.; Abbey, D.; Bezerra, A.R.; Carreto, L.; Moura, G.R.; Bayés, M.; Gut, I.G.; Csikasz Nagy, A.; Cavalieri, D.; Berman, J.; Santos, M.A.S. | Articolo in rivista | |
| 1-gen-2016 | Age and gender affect the composition of fungal population of the human gastrointestinal tract | Strati, F.; Di Paola, M.; Stefanini, I.; Albanese, D.; Rizzetto, L.; Lionetti, P.; Calabrò, A.; Jousson, O.; Donati, C.; Cavalieri, D.; De Filippo, C. | Articolo in rivista | |
| 1-gen-2016 | Altered gut microbiota in Rett syndrome | Strati, F.; Cavalieri, D.; Albanese, D.; De Felice, C.; Donati, C.; Hayek, J.; Jousson, O.; Leoncini, S.; Pindo, M.; Renzi, D.; Rizzetto, L.; Stefanini, I.; Calabrò, A.; De Filippo, C. | Articolo in rivista | |
| 1-gen-2013 | An evaluation of the PacBio RS platform for sequencing and de novo assembly of a chloroplast genome | Ferrarini, M.; Moretto, M.; Ward, J.A.; Surbanovski, N.; Stevanović, V.; Giongo, L.; Viola, R.; Cavalieri, D.; Velasco, R.; Cestaro, A.; Sargent, D.J. | Articolo in rivista | |
| 1-gen-2015 | Biodiversity of the human gut mycobiota and its adaptation to the gastrointestinal tract | Strati, F.; Stefanini, I.; Di Paola, M.; Rizzetto, L.; Cavalieri, D.; De Filippo, C. | Abstract in Atti di convegno | |
| 1-gen-2012 | Bioinformatic approaches for functional annotation and pathway inference in metagenomics data | De Filippo, C.; Ramazzotti, M.; Fontana, P.; Cavalieri, D. | Articolo in rivista | |
| 1-gen-2012 | BIOKIS: a model payload for multidisciplinary experiments in microgravity | Vukich, M.; Ganga, P.L.; Cavalieri, D.; Rizzetto, L.; Rivero, D.; Pollastri, S.; Mugnai, S.; Mancuso, S.; Pastorelli, S.; Lambreva, M.; Antonacci, A.; Margonelli, A.; Bertalan, I.; Johanningmeier, U.; Giardi, M.T.; Rea, G.; Pugliese, M.; Quarto, M.; Roca, V.; Zanini, A.; Borla, O.; Rebecchi, L.; Altiero, T.; Guidetti, R.; Cesari, M.; Marchioro, T.; Bertolani, R.; Pace, E.; De Sio, A.; Casarosa, M.; Tozzetti, L.; Branciamore, S.; Gallori, E.; Scarigella, M.; Bruzzi, M.; Bucciolini, M.; Talamonti, C.; Donati, A.; Zolesi, V. | Articolo in rivista | |
| 1-set-2015 | C. albicans with different genomic background reveal diverse host adaptation and differential processing by phagocytes | Rizzetto, L.; Di Paola, M.; Colombari, B.; De Filippo, C.; Ardizzoni, A.; Berná, L.; Tocci, N.; Lionetti, P.; Blasi, E.; Cavalieri, D.; Peppoloni, S. | Abstract in Atti di convegno | |
| 1-gen-2013 | Carbon nanotube scaffolds instruct human dendritic cells: modulating immune responses by contacts at the nanoscale | Aldinucci, A.; Turco, A.; Biagioli, T.; Toma, F.M.; Bani, D.; Guasti, D.; Manuelli, C.; Rizzetto, L.; Cavalieri, D.; Massacesi, L.; Mello, T.; Scaini, D.; Bianco, A.; Ballerini, L.; Prato, M.; Ballerini, C. | Articolo in rivista | |
| 1-gen-2013 | Characterization of fecal mycobiota reveals yeast-host coevolution in pediatric Crohn’s disease | De Filippo, C.; Di Paola, M.; Rizzetto, L.; Stefanini, I.; Berná, L.; Ramazzotti, M.; Dapporto, L.; Rivero, D.; Gut, I.G.; Legras, J.L.; Massi Benedetti, C.; De Luca, A.; Romani, L.; Lionetti, P.; Cavalieri, D. | Abstract in Atti di convegno | |
| 1-gen-2014 | Characterization of fungal and bacterial communities in Rett syndrome patients | Strati, F.; Albanese, D.; Donati, C.; Cavalieri, D.; De Filippo, C.; Renzi, D.; Jousson, O.; De Felice, C.; Hayek, J.; Calabrò, A. | Poster | |
| 1-gen-2015 | Characterization of the bacterial and fungal microbiota in Rett syndrome | Strati, F.; Albanese, D.; Renzi, D.; Rizzetto, L.; Stefanini, I.; Jousson, O.; Hayek, J.; De Felice, C.; Donati, C.; Calabrò, A.; Cavalieri, D.; De Filippo, C. | Abstract in Atti di convegno | |
| 1-set-2015 | Commensal yeast S. cerevisiae trains human monocytes for a heightened cytokine response upon bacterial encounter | Rizzetto, L.; Ifrim, D.I.; Tocci, N.; Cheng, S.C.; De Filippo, C.; Weil, T.F.A.L.; Lenucci, M.S.; Netea, M.G.; Cavalieri, D. | Abstract in Atti di convegno | |
| 1-gen-2015 | Comparative analysis of gene expression: uncovering expression conservation and divergence between Salmonella enterica serovar Typhimurium strains LT2 and 14028S | Sonego, P.; Meysman, P.; Moretto, M.; Viola, R.; Laukens, K.; Cavalieri, D.; Engelen, K.A. | Contributo in volume (Capitolo o Saggio) | |
| 1-gen-2015 | Comparative genomics of natural fertile hybrids of Saccharomyces cerevisiae, Saccharomyces bayanus and Saccharomyces paradoxus | Donati, C.; Stefanini, I.; Ramazzotti, M.; Berná, L.; Gut, I.G.; De Filippo, C.; Cavalieri, D. | Abstract in Atti di convegno | |
| 1-gen-2018 | Deciphering the mechanism of action of 089, a compound impairing the fungal cell cycle | Stefanini, I.; Rizzetto, L.; Rivero, D.; Carbonell, S.; Gut, M.; Heath, S.; Gut, I.G.; Trabocchi, A.; Guarna, A.; Ben Ghazzi, N.; Bowyer, P.; Kapushesky, M.; Cavalieri, D. | Articolo in rivista | |
| 1-gen-2014 | Diet and the gut microbiota: how the gut: brain axis impacts on autism | Tuohy, K.M.; Venuti, P.; Cuva, S.; Furlanello, C.; Gasperotti, M.; Mancini, A.; Ceppa, F.A.; Cavalieri, D.; De Filippo, C.; Vrhovsek, U.; Mena, P.; Del Rio, D.; Fava, F. | Contributo in volume (Capitolo o Saggio) |